Eni的Hpc5超級計算機在與Covid-19的戰鬥中做了什麼



Eni的Hpc5超級計算機在與Covid-19的戰鬥中做了什麼

與Covid-19的鬥爭也通過了Eni的技術:Hpc5超級計算機分析了700億個分子

在與Covid-19的戰鬥中,即使是計算機(超級計算機)也可以有所作為。幾週前,由生物製藥公司Dompé領導的歐洲項目Exscalate4CoV中的4台超級計算機(其中兩台是意大利計算機)被指定為可能用於治療冠狀病毒的藥物。

現在,作為同一項目的一部分,埃尼(Eni)的HPC5超級計算機啟動了世界上有史以來最複雜的分子超級計算實驗,目的是確定針對該病毒的新療法。所有細節。

ENI做了什麼

讓我們從最後一個挑戰開始。 11月20日(星期五)晚上,埃尼的超級計算機“啟動了世界上進行的最複雜的分子超級計算實驗,以發現針對這種病毒的新療法”。

本實驗

該實驗在費雷拉·埃爾博格諾尼(Ferrera Erbognone)的埃尼(Eni)綠色數據中心進行,並且通過模擬,可以測試該病毒的15個活躍相互作用位點上的700億個分子,僅在60小時內就評估了超過1000億次相互作用。 。

不只是ENI

埃尼的HPC5(世界上最強大的工業超級計算機),Cineca的Marconi100,軟件的計算能力(81 petaflops:每秒數億億次運算)的同時可用性使超級計算實驗成為可能。 Politecnico di Milano和Cineca以及Dompé的Exscalate分子庫加速了虛擬篩選。

米蘭理工大學負責Exscalate sw平台的開發和微調,其主要目標是優化和優化Exscalate對接庫,它指定了Exscalate4CoV的Linkedin頁面。

EXCALATE4COV項目

所有這些都是作為歐洲項目Exscalate4CoV的一部分進行的,該項目由Horizo​​n 2020資助,歐盟委員會提供了300萬歐元。

由SergioDompé領導並成立於1940年的生物製藥公司Dompé牽頭研究財團,該財團還包括Politecnico di Milano(電子,信息和生物工程學系),Cineca大學聯合體(超級計算創新和應用),米蘭大學(藥物科學系),魯汶大學凱瑟里耶克大學,國際華沙分子與細胞生物學研究所,Elettra Sincrotrone Trieste,弗勞恩霍夫分子生物學與應用生態研究所,BSC超級計算中心,費德里科第二大學ForschungszentrumJülich那不勒斯,卡利亞里大學,瑞士生物信息學研究所,Kth皇家技術學院(應用物理系),大數據協會,國家核物理研究所,國家傳染病研究所Lazzaro Spallanzani和Chelonia應用科學。

超級計算機

Dompé委託了4台超級計算機:Marconi del Cineca di Bologna,這是一個意大利的非盈利性大學間財團,其中包括69所意大利大學,8個國家研究機構,兩個綜合診所,ANVUR和教育部,大學和研究; Eni的HPC5 ;位於巴塞羅那的西班牙公共研究中心巴塞羅那超級計算中心的MareNostrum4; Julich中心的Juwels,這是德國Helmholtz-Gemeinschaft組織的研究中心

總共有100 Petaflops的計算能力。連接在一起的超級計算機已經驗證了冠狀病毒蛋白與市場上萬種藥物分子(主要是抗病毒劑)之間的相互作用,每秒執行5000億次操作, Il Sole 24 Ore指定

超級計算機的結果

如《開始》雜誌上寫的一些結果已經到達。四個超級計算機已經在雷洛昔芬分子中鑑定出了已經註冊並用於治療絕經後女性骨質疏鬆症的藥物,該藥物可能是治療Covid-19輕症患者的藥物。 DompéPharmaceuticals,弗勞恩霍夫研究所和魯汶大學已於2020年5月6日申請使用雷洛昔芬治療受Sars-CoV-2病毒感染的人的專利。

2020年10月27日,儘管多佩(Dompé)強調,AIFA還是批准了該藥的實驗

DOMPE的製動

但是要當心,在針對Covid的用途上,是Dompé自己遏制了熱情:“重要的是要強調一點,到目前為止,仍然沒有證據表明該分子對抗Sars-CoV-2的收益/風險比為正,或者使用劑量。因此,該藥物未在臨床試驗之外獲得許可用於此適應症,” 生物製藥公司在新聞稿中寫道。


這是在 Tue, 24 Nov 2020 05:30:32 +0000 在 https://www.startmag.it/sanita/cosa-ha-fatto-il-supercomputer-hpc5-di-eni-nella-lotta-a-covid-19/ 的報紙 “Scenari Economici” 上發表的文章的翻譯。