意大利的病毒基因組測序災難(與英國不同)



意大利的病毒基因組測序災難(與英國不同)

意大利是世界上排名靠前的國家之一。這是該領域最重要的歐洲研究所歐洲分子生物學實驗室(EMBL)所說的

去年12月,英國發現自己正面臨著新的感染激增,從每天的1萬例感染增加到7萬例。罪魁禍首是新的冠狀病毒株,其科學名稱為B117,更名為“英語變體”。聯合王國為應對第二波covid-19突變而部署的武器之一是測序,即對構成病毒DNA的所有單個單元的研究。測序對於查明病毒是否已突變以及是否有新的變異體在流通非常有用。在Rai 3上播放的Presa Diretta通過比較意大利發生的事情和整個海峽發生的事情,對這項活動進行了專門調查。歐洲分子生物學實驗室(EMBL)(該領域最重要的歐洲研究所)的領導人的啟示是有意義的

這是所有詳細信息。

英文變體:EMBL測序工作

EMBL副總監Ewan Birney說:“我們在9月首次在患者身上發現了所謂的'英語變體',但直到12月,我們才意識到它對直接吸入式麥克風的危險性。因此,我們通知了衛生當局,並與科學界共享了數據。 B117變種很快從倫敦傳播到其他歐洲國家,包括荷蘭,愛爾蘭,葡萄牙,德國和丹麥。在意大利,翁布里亞阿布魯佐(Abruzzo)記錄了第一批病例,但很快就會在全國范圍內出現。 “很長一段時間以來,病毒早晚在循環中流通,出現了突變組合,賦予了病毒不同的特徵-教授解釋說Francesco Lescai (帕維亞大學生物與生物技術系)-。英文變體在約3萬個字母的基因組中具有17個突變,可提高其與人類細胞結合的效率”。

英文變體:更具傳染性和更致命

“英語變種使這種病毒具有50%的傳染性,因此在一個月內,我們的感染率增加了8到10倍-Ewan Birney繼續說-。一個令人擔憂的方面,因為當傳染曲線上升時,無法控制大流行。 B117變種不僅具有更強的傳染性,而且更具致命性,一些研究認為死亡比原始病毒多15-20% 。一個非常難處理的客戶。不足為奇的方法是通過研究病毒的測序來增加監視。測序意味著獲取整個病毒基因組並完整讀取它-教授補充說。弗朗切斯科·萊斯卡(Francesco Lescai)-。這是確定哪種病毒感染了該人。意大利每千支陽性拭子僅測序1次。太少了。

意大利在同類課程中排名最後

我國是世界上排名靠前的國家之一。在Presa Diretta的排名中,我們的國家僅次於孟加拉國,斯里蘭卡和阿曼。在一年的時間裡,我們僅對2000萬歐洲拭子英國25萬進行了測序。 EMBL的副主任說:“我認為意大利可以做得更多。作為EMBL,我們是歐洲機構,願意幫助其他國家迅速收集和共享該病毒及其變體的遺傳數據”。意大利在國際數據庫中的變體報告方面也遠遠落後。 “我們的平均存款時間為70天,即使從樣本收集開始的300天之後,仍有數據被保存-教授承認。萊斯凱-好多英格蘭平均有24天的存款時間”。

在意大利,每5名感染者中就有1名患有英語

意大利的首批“英語變異”案例於2020年12月21日獲得認證。衛生部僅在1月31日發布第一份通函。建議包括每周至少重新建立接觸者追踪和測序500個棉籤。 “英國每週要檢出不少於一萬支棉籤-伊万·伯尼(Ewan Birney)補充說。我認為每個國家應至少排序5%的陽性冰爪,最好是10%。這是可行的,意大利有出色的基因組學科學家可以做到”。如今,在意大利陽性人群中,五分之一的人表示該病毒的英文版本。測序非常重要,因為它使我們能夠了解該國正在傳播的毒株,並在醫院裝滿之前使自己有能力阻止這種傳播。它也有助於密切注意疫苗耐藥性突變。

疫苗抗性:變異的另一面

疫苗抗性是南非和巴西變異體剝奪醫生和科學家睡眠的原因。 EMBL的副主任總結說:“南非變種目前是最令人擔憂的,這不僅是因為它傳播更多,而且還因為它能夠逃避抗體。這意味著,如果一個人已經感染了Covid-19,他們可能會再次生病。所有疫苗都不適用於南非變種,至少在預防輕度形式方面無效。我們預計會有更多的變異,因為大規模疫苗接種會增加病毒的壓力和逃避抗體的能力。我們在盡可能短的時間內為盡可能多的人接種疫苗。但是,讓我們考慮到必須進行第三次針對最新變體的召回”。這些疫苗是針對第一種Sars-cov2病毒(武漢)設計的。但是,得益於信使RNA技術,疫苗可以很快進行修飾。 “所有國家都必須進行疫苗監視。報告結尾處的Armando Genazzani (人類醫學藥物委員會EMA)說,有必要監視有多少人被感染並確認安全性已得到確認。 EMA將看到此數據並可以採取措施。數據越強大,疫苗就越強大。


這是在 Thu, 25 Feb 2021 08:39:49 +0000 在 https://www.startmag.it/sanita/disastro-sequenziamento-del-genoma-del-virus-in-italia-a-differenza-della-gran-bretagna/ 的報紙 “Scenari Economici” 上發表的文章的翻譯。